Từ ngày 1/10/2022, cơ cấu tổ chức của Ủy ban được thay đổi theo Điều 3, Nghị định số 66/2022/NĐ-CP ngày 20 tháng 9 năm 2022 của Chính phủ[15]

Các đơn vị thực hiện chức năng quản lý nhà nước

• Văn phòng
• Thanh tra
• Vụ Kế hoạch - Tài chính
• Vụ Tổ chức cán bộ
• Vụ Pháp chế
• Vụ Hợp tác quốc tế
• Vụ Tổng hợp
• Vụ Chính sách dân tộc
• Vụ Tuyên truyền
• Vụ Dân tộc thiểu số
• Vụ Công tác dân tộc địa phương

Các đơn vị sự nghiệp

• Học viện Dân tộc (Từ Liêm, Hà Nội)
• Trường Dự bị Đại học Dân tộc Trung ương Nha Trang (Nha Trang, Khánh Hòa)
• Trường Dự bị Đại học Dân tộc Sầm Sơn (Sầm Sơn, Thanh Hóa)
• Trường Dự bị Đại học Dân tộc Trung ương (Việt Trì, Phú Thọ)
• Trường Dự bị Đại học Thành phố Hồ Chí Minh
• Trường Phổ thông Vùng cao Việt Bắc (Thái Nguyên)
• Trung tâm Chuyển đổi số
• Báo Dân tộc và Phát triển
• Tạp chí Dân tộc
• Nhà khách Dân tộc

Các tổ chức khác

• Văn phòng Ban cán sự đảng
• Văn phòng Chương trình mục tiêu quốc gia
• Ban Quản lý Dự án đầu tư chuyên ngành xây dựng